L’académie de Nantes fait partie de la région académique Pays de la Loire qui comprend une seule académie.

La région académique découle de l’application du cadre régional fixé par la loi du 16 janvier 2015, avec la création de 17 régions. Elle constitue l’échelon de mise en cohérence des politiques éducatives régionales, en particulier pour les questions requérant une coordination avec la région ou le préfet de région dans les domaines suivants :

• formation professionnelle, apprentissage et orientation tout au long de la vie professionnelle
• définition du schéma prévisionnel des formations des établissements publics locaux d’enseignement
• enseignement supérieur et recherche
• lutte contre le décrochage scolaire
• service public numérique éducatif
• utilisation des  fonds européens
• contribution aux contrats de plan État-Région.

L’académie de Nantes conserve par ailleurs son organisation et ses missions.

La rectrice de la région académique Pays de Loire est la rectrice de l’académie de Nantes. Elle est l’interlocutrice des autorités régionales (préfet de région, président du conseil régional).